Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RDH16O75452 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RDH16O75452 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RDH16O75452 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH16O75452 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH16O75452 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RDH16O75452 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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