Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVV-2B6SEH9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms