Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL33A6NCF5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms