Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPOA2VEC9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms