Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC144AA2RUR9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms