Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX8Q9Y5X2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX8Q9Y5X2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms