Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA3Q9UL41 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms