Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms