Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDE1Q9NZC3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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