Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MIS18AQ9NYP9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms