Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSD3Q9NYI0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms