Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPHK2Q9NRA0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPHK2Q9NRA0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms