Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms