Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms