Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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