Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP1Q9C000 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms