Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SSBP4Q9BWG4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SSBP4Q9BWG4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SSBP4Q9BWG4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SSBP4Q9BWG4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms