Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPPD1Q9BV87 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPPD1Q9BV87 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPPD1Q9BV87 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNPPD1Q9BV87 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms