Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms