Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMM29Q9BSF4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms