Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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