Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3GL3Q99963 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms