Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBBP8Q99708 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP8Q99708 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms