Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SORT1Q99523 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SORT1Q99523 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms