Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHOX2BQ99453 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHOX2BQ99453 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms