Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SGCZQ96LD1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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