Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms