Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCARF2Q96GP6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms