Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MVB12AQ96EY5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms