Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NXNL1Q96CM4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NXNL1Q96CM4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms