Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113Q902F9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113Q902F9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms