Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM41Q8WV44 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM41Q8WV44 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms