Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HJURPQ8NCD3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms