Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms