Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFRP1Q8N474 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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