Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPTE2Q6XPS3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms