Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC174Q6PII3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms