Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H3F3CQ6NXT2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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H3F3CQ6NXT2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3CQ6NXT2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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