Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF220Q5VTB9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms