Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms