Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PERM1Q5SV97 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms