Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms