Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GREB1Q4ZG55 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms