Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF1Q3BBV0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF1Q3BBV0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms