Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RTL8BQ17RB0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RTL8BQ17RB0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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