Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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ATP6V1FQ16864 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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