Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCK2Q16822 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms