Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NRF1Q16656 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NRF1Q16656 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms