Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ZNF239Q16600 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ZNF239Q16600 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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