Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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VAMP3Q15836 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
VAMP3Q15836 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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